截至2014年1月，東南大學(xué)擁有29個博士學(xué)位一級學(xué)科授權(quán)點，49個碩士學(xué)位一級學(xué)科授權(quán)點， 5個國家一級重點學(xué)科（涵蓋15個二級學(xué)科），5個國家二級重點學(xué)科，1個國家重點（培育）學(xué)科，11個江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程一期項目立項學(xué)科（群），14個江蘇省一級學(xué)科重點學(xué)科，28個博士后科研流動站。

在2012年第三輪全國學(xué)科評估中，15個學(xué)科進(jìn)入前20%，有12個學(xué)科進(jìn)入全國前七位，有10個學(xué)科位列全國前五位，其中生物醫(yī)學(xué)工程、交通運輸工程、藝術(shù)學(xué)理論等3個學(xué)科位列全國第一位，建筑學(xué)、電子科學(xué)與技術(shù)、風(fēng)景園林學(xué)等3個學(xué)科位列全國第二位，土木工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)等2個學(xué)科位列全國第三位，信息與通信工程位列第四位，儀器科學(xué)與技術(shù)位列第五位，動力工程及工程熱物理位列第六位，公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)位列第七位，排名第一的學(xué)科數(shù)并列全國高校第七位。工程學(xué)、材料科學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)和計算機(jī)科學(xué)等7個學(xué)科進(jìn)入ESI世界前1%；工程學(xué)上升到第83位 。

國家重點學(xué)科

一級學(xué)科重點學(xué)科（5個）

1、電子科學(xué)與技術(shù)（物理電子學(xué)，電路與系統(tǒng)，微電子學(xué)與固體  電子學(xué)，電磁場與微波技術(shù)）

2、信息與通信工程（通信與信息系統(tǒng)，信號與信息處理）

3、建筑學(xué)（建筑歷史與理論，建筑設(shè)計及其理論，城市規(guī)劃與設(shè)計，建筑技術(shù)科學(xué)）

4、交通運輸工程（道路與鐵道工程，交通信息工程及控制，交通運輸規(guī)劃與管理，載運工具運用工程）

5、生物醫(yī)學(xué)工程（不分設(shè)二級學(xué)科）

二級學(xué)科重點學(xué)科（5個）

藝術(shù)學(xué)，熱能工程，控制理論與控制工程，計算機(jī)應(yīng)用技術(shù)，結(jié)構(gòu)工程

國家重點（培育）學(xué)科（1個）

機(jī)械制造及其自動化

江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程一期項目立項學(xué)科（群）（11個）

電子科學(xué)與技術(shù)、信息與通信工程、控制科學(xué)與工程、計算機(jī)
科學(xué)與技術(shù)、建筑學(xué)、土木工程、交通運輸工程、生物醫(yī)學(xué)工程、醫(yī)學(xué)技術(shù)、新材料及其應(yīng)用（主要依托學(xué)科：材料科學(xué)與工程、機(jī)械工程、化學(xué)工程與技術(shù)）、新能源發(fā)電與利用（主要依托學(xué)科：動力工程及工程熱物理、電氣工程）

一級學(xué)科省重點學(xué)科（14個）

哲學(xué)、數(shù)學(xué)、生物學(xué)、 統(tǒng)計學(xué)、光學(xué)工程、儀器科學(xué)與技術(shù)、環(huán)境科學(xué)與工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)、風(fēng)景園林學(xué)、軟件工程、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、管理科學(xué)與工程、藝術(shù)學(xué)理論

 

博士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點（29個）

哲學(xué)、應(yīng)用經(jīng)濟(jì)學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、生物學(xué)、統(tǒng)計學(xué)、機(jī)械工程、光學(xué)工程、儀器科學(xué)與技術(shù)、材料科學(xué)與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、電子科學(xué)與技術(shù)、信息與通信工程、控制科學(xué)與工程、計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、建筑學(xué)、土木工程、化學(xué)工程與技術(shù)、交通運輸工程、環(huán)境科學(xué)與工程、生物醫(yī)學(xué)工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)、風(fēng)景園林學(xué)、軟件工程、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、管理科學(xué)與工程、藝術(shù)學(xué)理論

碩士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點（49個）

哲學(xué)、 應(yīng)用經(jīng)濟(jì)學(xué)、法學(xué)、社會學(xué)、馬克思主義理論、教育學(xué)、心理學(xué)、體育學(xué)、中國語言文學(xué)、外國語言文學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、生態(tài)學(xué)、統(tǒng)計學(xué)、力學(xué)、 機(jī)械工程、光學(xué)工程、儀器科學(xué)與技術(shù)、材料科學(xué)與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、電子科學(xué)與技術(shù)、信息與通信工程、控制科學(xué)與工程、計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、建筑學(xué)、土木工程、水利工程、測繪科學(xué)與技術(shù)、化學(xué)工程與技術(shù)、交通運輸工程、環(huán)境科學(xué)與工程、 生物醫(yī)學(xué)工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)、風(fēng)景園林學(xué)、軟件工程、 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、管理科學(xué)與工程、工商管理、公共管理、圖書情報與檔案管理、藝術(shù)學(xué)理論、美術(shù)學(xué)、設(shè)計學(xué)